Η Διεύθυνση Αγροτικών Υποθέσεων Ηπείρου είναι αρμόδια ιδίως για θέματα αναδασμού και εποικισμού, καθώς και για θέματα γεωργικών εκμεταλλεύσεων και αλιείας στην Περιφέρεια Ηπείρου σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία.
Οφείλει να βρίσκεται σε συνεχή συνεργασία με το καθ’ ύλην αρμόδιο Υπουργείο για την καλύτερη αντιμετώπιση των προβλημάτων και των υποθέσεων αρμοδιότητάς της και να ακολουθεί τις οδηγίες του.
Η Διεύθυνση Αγροτικών Υποθέσεων Ηπείρου έχει έδρα τα Ιωάννινα και συγκροτείται από τα ακόλουθα Τμήματα, τα οποία έχουν επίσης έδρα τα Ιωάννινα:
α) Τμήμα Αναδασμού και εποικισμού
β) Τμήμα Γεωργικών Εκμεταλλεύσεων και Αλιείας